生物安全柜的基本工作原理主要是將柜內(nèi)空氣向外抽吸，使柜內(nèi)保持負壓狀態(tài)、安全柜內(nèi)的氣體不能外泄從而保護工作人員;外界空氣經(jīng)高效空氣過濾器過濾后進入安全柜內(nèi)，以避免處理樣品被污染;柜內(nèi)的空氣也需經(jīng)過高效空氣過濾器過濾后再排放到大氣中以保護環(huán)境。 為了防止氣流干擾，要求不得將設備安裝在人員往來的通道中，并且不得使生物安全柜滑動前窗操作口正對實驗室的門窗或靠門窗太近，應遠離人員活動，物品流動及可能會擾亂氣流的地方。
生物安全柜柜內(nèi)操作主要注意事項：
?。?、緩慢移動原則：為了避免影響正常的風路狀態(tài)，柜內(nèi)操作時手應該盡量平緩移動。
２、不同樣品柜內(nèi)移動原則：柜內(nèi)兩種及以上物品需要移動時，一定遵循低污染性物品向高污染性物品移動原則，避免污染性高的物品在移動過程中產(chǎn)生對柜體內(nèi)部的大面積污染。
?。?、物品平行擺放原則：為了避免物品和物品之間的交叉污染現(xiàn)象產(chǎn)生，在柜內(nèi)擺放的物品應該盡量呈橫向一字擺開，避免回風過程中造成交叉污染。同時避免堵塞背部回風隔柵影響正常風路。
?。?、明火使用原則：柜內(nèi)盡量不要使用明火！因為在明火使用過程中產(chǎn)生的細小顆粒雜質(zhì)將被帶入濾膜區(qū)域，這些高溫雜質(zhì)會損傷濾膜。無法避免一定需要使用的時候，宜使用低火苗的本生燈。
５、避免震動原則：柜內(nèi)盡量避免震動儀器（例如離心機、旋渦振蕩器等）的使用，因為震動會使得積留在濾膜上的顆粒物質(zhì)抖落，導致操作室內(nèi)部潔凈度降低，同時如果在前操作面平衡失敗還會引起安全柜對操作者的污染。
